הסרת זיהומים וסינון של התהליך הבסיסי של פונקציית מערכת האיטום המכני

הסרת זיהומים כגון חלקיקים מוצקים היא פונקציה בסיסית של מערכת האיטום המכאנית. ניתן להשתמש במסננים או בהידרוציקלונים להסרת זיהומים במערכת. מסננים למערכות איטום מכאניות כוללים מסכי סינון, טבעת מגנטית ומסכי סינון, המתאימים למקרה בו צפיפות הרכיבים המוצקים קרובה או קטנה מזו של הנוזל האטום. דיוק ההפרדה שלו הוא 10~100um, אך קל לחסום אותו, ולכן יש להשתמש בו במקביל. . המסנן עם הטבעת המגנטית יכול להסיר חלקיקים מגנטיים.